في 14 مايو 1985، شهدت مسيرة كرة القدم المصرية حدثاً تاريخياً، حيث شارك اللاعب حسام حسن، الذي كان ناشئاً وقتها، في أول مباراة رسمية له مع النادي الأهلي تحت إشراف المدرب الراحل محمود السايس. جاءت هذه المباراة أمام فريق الترسانة وانتهت بفوز الأهلي بهدفين دون مقابل سجلهما محمد رمضان. خلال مسيرته مع الأهلي، لعب حسام حسن 300 مباراة وسجل 142 هدفاً، بما في ذلك 234 مباراة في الدوري حيث تمكن من إحراز 109 أهداف، مما يجعله الهداف التاريخي للأهلي في هذه المسابقة إلى جانب محمود الخطيب.
حقق حسام حسن مع الأهلي العديد من البطولات، حيث توج بـ11 بطولة دوري ممتاز و4 كؤوس مصر، بالإضافة إلى دوري أبطال أفريقيا مرة واحدة و4 بطولات لأفريقيا للأندية أبطال الكؤوس، فضلاً عن بطولة أفرو آسيوية واحدة، وبطولة عربية للأندية أبطال الدوري وبطولة عربية للأندية أبطال الكؤوس وكأس السوبر العربي مرة واحدة.
وعند انتقاله إلى الزمالك، لعب حسام حسن 107 مباريات وسجل 54 هدفاً. في الدوري المصري، لعب 61 مباراة ونجح في تسجيل 38 هدفاً، وفي كأس مصر لعب 7 مباريات سجل خلالها هدفين، وفي كأس السوبر المصري كانت له مشاركة في 3 مباريات حيث سجل هدفاً. أما في البطولات الإفريقية، فقد شارك في 23 مباراة وأحرز 10 أهداف، وفي البطولات العربية لعب 13 مباراة وسجل 3 أهداف.
مع الزمالك، حصد حسام حسن 3 بطولات دوري ممتاز، وبطولة واحدة لكأس مصر، وبطولتين في السوبر المحلي، بالإضافة إلى دوري أبطال أفريقيا وكأس السوبر الإفريقي مرة واحدة، وبطولة عربية واحدة.