توج نادي إنبي ببطولة كأس مصر للمرة الأولى في تاريخه بعد فوزه على الاتحاد السكندري بهدف نظيف سجله مجدي عبد العاطي، وذلك في المباراة التي أقيمت في 20 مايو 2005 على استاد عثمان أحمد عثمان في الجبل الأخضر.
انتهى الوقت الأصلي للمباراة بالتعادل السلبي، ليتجه الفريقان إلى الأشواط الإضافية، حيث تمكن مجدي عبد العاطي من إحراز هدف البطولة في الدقيقة الثالثة من الشوط الإضافي الثاني. يُعتبر إنبي، الذي تأسس عام 1985، واحداً من الفرق التي أحدثت تأثيراً كبيراً في الكرة المصرية منذ صعوده إلى الدوري الممتاز في موسم 2002/2003 تحت قيادة المدرب الراحل طه بصري.
يُعد إنبي عميد الأندية البترولية، وله تاريخ طويل ومساهمات كبيرة في تطوير كرة القدم المصرية ومنافسة الأندية الكبرى. وقد توج إنبي بلقب الكأس للمرة الثانية في عام 2011 بعد الفوز على الزمالك بهدفين مقابل هدف، حيث كان عمرو زكي قد افتتح التسجيل للزمالك، لكن عادل مصطفى عدل النتيجة، وأحرز أحمد عبد الظاهر هدف الفوز في الدقيقة 81.
شارك إنبي في كأس السوبر المصري ثلاث مرات كانت جميعها ضد الأهلي في أعوام 2005 و2006 و2012، وانتهت أول مباراتين بفوز الأهلي 1/0، بينما انتهت المباراة الثالثة بفوز الأهلي 2/1.
كما شارك النادي في دوري أبطال العرب في أعوام 2003 و2006 و2007، وفي دوري أبطال أفريقيا عام 2006، بالإضافة إلى مشاركته في كأس الاتحاد الإفريقي في أعوام 2007 و2009 و2012.
حصل إنبي على المركز الثاني في الدوري الممتاز خلال موسم 2004/2005 بعد ثلاث سنوات من صعوده. وقد برز في صفوف إنبي العديد من نجوم الكرة المصرية، من بينهم سيد عبد النعيم ومجدي عبد العاطي وسمير صبري وعمرو زكي وأحمد المحمدي وعبد العزيز توفيق وأحمد رؤوف وعبد الظاهر السقا وأحمد عبد الظاهر وصالح جمعة ومؤمن زكريا ومحمود كهربا وحمدي فتحي ووليد سليمان.